MotivationForSuccess

서론 이번 시간에는 RNA-Sequencing 데이터 분석 과정중 가장 첫번째로 해야하는 과정인 Quality control(QC) 과정에 대해서 알아보겠습니다. RNA-Sequencing을 하게 되면 FASTQ파일이 나오게 되는데요. 보통 raw fastq파일이라고 합니다. 이 fastq 파일의 퀄리티를 확인하는 과정이 먼저 필요하게 되는거죠! [바이오인포매틱스] Fastq 파일형식 FASTQ format ​ 'AGCT'로 표현되는 생물학적 sequence와 아스키 코드 (ASCII) 문자로 표시된 각 염기에 대한 quality (Phred)score를 모두 저장하기 위한 Text-based format으로 주로 NGS 기술로 생산된 sequenci.. develsw.tistory.com NGS란? 서..

RNA-Sequencing이란? RNA-Sequencing 기술은 NGS 기반으로 시퀀싱을 하는데, DNA에서 전사된 RNA를 시퀀싱하는 것을 말합니다. RNA 수준에서 알 수 있는건 Alternative splicing이나 유전자들의 발현량 등을 확인할 수 있죠. 이번 게시글에서는 대표적인 Bulk RNA-Seq 데이터를 분석하는 과정에 대해서 알아보겠습니다. Single cell RNA-Sequencing 데이터 분석 과정은 나중에 알아보도록할게요! NGS란? 서론 이번 게시글에서는 Next Generation Sequencing (NGS)가 무엇인지에 대해 알아보도록 하겠습니다. NGS는 한국어로 해석하면 차세대 염기서열 분석법이라고 부릅니다. 물론 현재는 차세대라고 하기에 develsw.tisto..